Detective Conan: The Darkest Nightmare (2016) Kisah pembunuhan yang aneh. Semuanya dimulai dengan pencurian file rahasia dari MI6 miliknya di Inggris, CSIS di Kanada, BND miliknya di Jerman, serta CIA dan FBI miliknya di AS. Pembunuhan aneh terjadi di seluruh dunia. Semua orang lelah menyelesaikan tugas mencatat informasi. Seorang wanita pergi ke markas komando pusat polisi untuk mengambil file misterius yang berisi daftar agen Organisasi Bayangan. Namun yang mengejutkan, pencurian tersebut diketahui polisi. Para penyerang, yang mengenakan jubah hitam, melarikan diri dengan mobil curian.
Pengejaran berlangsung intens. Rei Furuya mengejar pelaku dengan mobil Mazda RX-7 miliknya. Meski begitu, dua orang joki kini berjaga di tengah jalan sehingga menimbulkan kerusakan parah. Baru-baru ini terjadi kecelakaan atau tabrakan besar, Shuichi Akai memboikot mobil penjahat tersebut hingga meledak. Apapun yang terjadi, konflik tidak bisa dihindari. Kap Colt Passage bergaris merah-putih Shuichi rusak.
Lebah itu jatuh dari jalan. Pagi harinya, Conan, Dr. Agasa, Haibara, dan para analis berkumpul. Mereka mengujinya di ruangan yang baru direnovasi di Toto Aquarium.
Dalam perjalanan menuju pertemuan tersebut, mereka menemukan seorang wanita yang terluka sedang menari dalam kesusahan. Ternyata wanita ini mengalami gangguan ingatan. Dia tidak mengenali dirinya sendiri. Feature phone miliknya rusak. Dalam kasus ini, sangat sulit untuk menentukan siapa wanita yang terluka tersebut. Pada akhirnya Conan memilih pergi bersama wanita itu. Dia membutuhkannya untuk pulih dengan cepat dan dia berusaha terlalu keras untuk mendapatkan ingatannya kembali. Sagebrush mengintai di jantung pengaturan penyelamatan ini. Conan dan yang lainnya tidak tahu apa-apa tentang hal itu.