Kuntilanak 3 (2008) Dinda (Nicole Rossi), yang dianggap aneh oleh anak kampung karena kekuatannya, tanpa sengaja melukai Panji (Adlu Fahrezy) dan Ambar (Ciara Brosnan). Maka Dinda meminta Tante Dona (Nena Rosier) untuk mendaftarkannya ke Sekolah Mata Hati agar dia bisa belajar mengendalikan kekuatannya. Di sekolah itu, Dinda langsung berteman bernama Dennis (Farras Fatik) dan Uchie (Clarice Cutie). Namun, kakak Dinda Miko (Ali Fikry) dan Kresna (Andryan Bima) menyelidiki sekolah tersebut dan menemukan hal-hal aneh, seperti banyak siswa yang hilang.
Di sisi lain, sebagai kepala sekolah, Baskara (Wafda Saifan) merasa kehadiran Dinda memancarkan aura yang istimewa. Baskara melaporkan hal tersebut kepada pendiri sekolah, Eyang Sukma (Sara Wijayanto), yang tinggal secara rahasia dan tidak terlihat oleh para siswa.